Татьяна, добрый день,
 
При перелете с животными немаловажен выбор авиакомпании, т.к. у каждой существуют свои дополнительные условия на перевозку питомцев, которые уточняются непосредственно перед вылетом.
Кроме того, есть правила, а есть конкретная ситуация. Например, экипаж самолета может допустить в салон довольно крупную собаку даже без предварительной просьбы.
Но если авиаперевозчик разрешил взять собаку в салон, то контейнер с собакой должен помещаться под кресло впереди сидящего пассажира и иметь такие размеры, чтобы собака могла свободно вставать, ложиться и поворачиваться, не касаясь верхней стенки.
 
Также у разных авиакомпаний  отличаются требования к переноскам. У кого-то как, например, у KLM, они строго должны быть пластмассовые с металлической дверцей и без колесиков, кто-то требует, чтобы дверца обязательно должна закрываться на замок, а дно контейнера должно быть покрыто адсорбирующим материалом.
Безусловно, собаки к транспортировке допускаются чистые, не имеющие неприятного запаха, часто эту информацию можно найти в инструкции по транспортировке четвероногого груза, например: «...животное не может причинять неудобства другому пассажиру, если он аллергик или если оно издает звуки...»
Итак, можно сделать заключение, что экипаж самолета оставляет за собой право пересадить пассажира с собакой на другое место или отправить животное в багажное отделение.
Все очень индивидуально, поэтому необходимо заранее делать запрос в авиакомпанию, которая будет осуществлять перевозку.